搭建基因测序云平台从数据分析切入精准医疗市场
2016年,中国科技部近期公布的国家重点研发计划中,精准医疗名列国家重点研发计划首位。随着测序成本的上升、基因大数据分析的较慢发展,精准医疗于是以步入风口。据BBCResearch预测,2015年全球精准医疗市场规模近600亿美元,今后5年年增长速度预计为15%,是医药行业整体增长速度的3至4倍。
在精准医疗中,基因检测公司获取的服务仅有流程还包括三个部分:样本处置、测序、数据分析。与其他基因检测公司一样,承启医学也获取仅有流程服务(尤其是超强微量核酸建库测序等前沿项目),此外,还分开获取数据分析业务,数据分析与临床理解是我们的强项。在样本处置环节中,外泌体、超强微量建库、RNC-RNA等高难度样本处置也是我们的特色。
承启医学的CEO余卓称之为。 在数据分析这块,承启医学的高通量基因数据云分析平台,基于其自律研发的高精度FANSe系列算法搭起,主要还包括DNA、大小RNA、翻译成组、16S、宏基因组等分析模块,可展开基因组和mRNA组的多层面分析。该平台操作者非常简单,用户不必须涉及的专业背景,只需通过网络将基因测序数据上传遍云端,一键式分析,就能较慢高效地提供关于基因数据的生物学及医学理解结果。
目前基因检测行业仅次于的问题是测序数据的准确性,许多基于测序的结果都不能反复。比如同一个样本送往有所不同公司做到基因检测,常常不会获得有所不同的结果。如果基因测序本身不许,不会必要造成身体健康咨询或临床环节经常出现假阳性、假阴性,这与精准医疗背道而驰。
除了准确性问题,还有一个临床医学理解问题。如果只有生物学信息,没临床医学理解,精准医疗也无从谈起。余卓称之为。
承启医学的云平台数据分析能在相当大程度上解决问题准确性和医学理解这两个问题。在数据定这个层面,我们的FANSe核对算法由首席科学家张弓教授从2008年起开始研究,能很好地解决传统算法中精度严重不足、实验结果受限于操作者经验、容错能力差的问题,修正样本处置及测序过程产生的误差,构建高精度的测序数据分析。此外,该云平台不具备高效率的批处理能力,能分担海量数据计算出来任务。在超过某种程度甚至更高精度的条件下,FANSe系列算法比传统算法所需的测序通量更加较低,从而明显减少测序成本。
FANSe系列算法曾取得国际人类蛋白质组计划的采纳和接纳,其中大量成果都标示提到了FANSe算法。
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